Видът на организационната структура, която компанията избира да използва, ще се отрази на взаимоотношенията със служителите, обслужването на клиентите и бизнес отношенията. Целта на органичната организационна структура е да осигури гъвкавост за промени, които могат да бъдат инициирани от служителите. Плосък организационен модел, който ограничава степента на йерархия в организацията, той се изгражда около мислите, нуждите и обратната връзка на служителите или работниците. Въпреки че органичната организационна структура насърчава демокрацията на работното място, тя има недостатъци, които се нуждаят от разглеждане.
Без граници
Членовете на организацията определят границите на органичната организационна структура. Това означава, че правилата, границите и стандартите могат да бъдат постоянно променящи се в зависимост от влиянието на членовете на екипа. Това може да работи добре в някои организации, но може да доведе до алчност и егоистични мотиви вместо корпоративна отговорност. Липсата на граници може също да повлияе на отношенията с клиентите, ако на клиента се дават различни отговори на същия въпрос.
Непродуктивни директиви
Когато ръководството дава директиви, тези директиви могат да станат непродуктивни поради липса на мотивация. Например, ако една органична организационна структура беше въведена в местна правоприлагаща агенция, необходимостта от спешно и незабавно насочване нямаше да съществува. В тази ситуация е необходима по-авторитетна организационна структура, при която подчинените отговарят незабавно на поръчките.
Неефективно лидерство
Ако властта е в ръцете на служителя, тя може да доведе до неефективно ръководство. Например, ако служителите са свикнали да управляват себе си и тогава лидерът се опитва да приложи промени, служителите може да не отговорят на посоката, защото те се възприемат като лидерство. Ръководството в органична организационна структура трябва да остане дефинирано и активно включено в процеса на вземане на решения и прилагане на политики. Органичната организационна структура може също да премахне висшето ръководство от ежедневните дела на бизнеса.
Бариери за комуникация
Органичната организационна структура може да създаде бариери за комуникация между отделите. Тъй като отделите са самоуправляващи се, лесно може да възникне конфликт между два отдела, които не виждат нещата по същия начин. Друга комуникационна бариера е липсата на определение. Ако всеки отдел определи различни политики по различен начин, един отдел може да не разбира съобщението, което изпраща друг отдел.
